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PCR 技術(shù)在遺傳病診斷中的應(yīng)用   

       自從1985年P(guān)CR技術(shù)首次應(yīng)用于遺傳病基因診斷以來(lái),已有近百種遺傳病可用PCR 技術(shù)進(jìn)行診斷和產(chǎn)前診斷,利用PCR 技術(shù)診斷遺傳病的途徑有五個(gè),① 基因突變位點(diǎn) 的直接檢出 ② 篩查與遺傳病 ③ 有關(guān)的點(diǎn)突變 ④ 遺傳多態(tài)性標(biāo)記連鎖分析間接診斷 ⑤ 利用cmRNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA進(jìn)行分析或直接分析cmRNA。傳統(tǒng)的基因診斷技術(shù)主要是以基因探針技術(shù)為基礎(chǔ)而建立的一些檢測(cè)方法,包括 Southerninnouthern印跡雜交,RFLP為,它們可直接分析基因的缺失和重排,亦可利 用RFLP時(shí)行連鎖分析,但由于這些技術(shù)操作繁瑣,探針來(lái)源困難所需設(shè)劑昂貴,且要用同抗素.完成一項(xiàng)診斷需要的時(shí)間亦較長(zhǎng),因此難于滿足臨床診斷的要求,限制了它在臨床上的應(yīng)用。PCR 技術(shù)是一種在體外的海促DNA合成技術(shù),它能在短時(shí)間內(nèi)將靶DNA 擴(kuò)增百萬(wàn)倍,而且操用簡(jiǎn)便,省時(shí),準(zhǔn)確性也高,它不僅能直檢突變基因,而且可與其它技術(shù)結(jié)合,使其診斷的準(zhǔn)確性幾達(dá)100%。而且不同同位素操作,能最大限度的滿足臨床診斷的需要。因而它已成為目前遺傳病診斷的產(chǎn)前診斷的主要手段.。

       一、PCR 技術(shù)診斷遺傳病的基本條件   

       PCR 技術(shù)的基本原理是利用一對(duì)引物為介導(dǎo),在體外模擬天然DNA復(fù)制過(guò)程的技術(shù),從生化的角度來(lái)看,它是一種海促反應(yīng),因此其反應(yīng)的過(guò)程中必須有酶的底物, 在這里酶為DNA聚合酶,沒(méi)酶是有耐熱性,底物為4種脫氯乙磷酸核菌酸。它所需要的 另一條件為引物,引物是根據(jù)已知的基因片段合成的一段20時(shí)左順的互解序列,因此,要進(jìn)行PCR 檢測(cè),除了具備酶,底物及其它基本因素外,利用已知的基因結(jié)構(gòu)合 成一對(duì)引物是PCR 診斷遺傳病的最基本條件,也就是說(shuō),說(shuō)遺傳病的基因結(jié)構(gòu)必須部 分或全部清楚。

       二、利用PCR 技術(shù)診斷遺傳病的途徑

       (一) PCR 技術(shù)直接診斷遺傳病  

       對(duì)于由基因缺失突變引起的遺傳病可利用缺失區(qū)域還側(cè)的DNA序列引物直接擴(kuò)增 該區(qū)域,看有無(wú)特異性的擴(kuò)增產(chǎn)物,這對(duì)缺失部位固定的片段檢測(cè)非常準(zhǔn)確簡(jiǎn)便,只 需一對(duì)引物即可完成,而對(duì)于哪些缺失部位異質(zhì)的基因則可利用多對(duì)引物進(jìn)行多重PCR ,然后檢查缺失帶。對(duì)基因的重排來(lái)說(shuō),可通過(guò)用RT-PCR 檢測(cè)mRNA的融合情況來(lái)檢 出,括入亦可用PCR 方法來(lái)檢出,當(dāng)點(diǎn)突變影響到限制內(nèi)性切酶切點(diǎn)時(shí),可用PCR -RFL P進(jìn)行分析,即將擴(kuò)增產(chǎn)物用適當(dāng)?shù)膬?nèi)切酶切割,然后據(jù)電泳圖譜復(fù)制判斷有無(wú)內(nèi)切 酶切點(diǎn)的改變,它比傳統(tǒng)的RFLP檢測(cè)法快速簡(jiǎn)便,且不受同位素的危害。若突變優(yōu)點(diǎn) 及性質(zhì)已知,可用PCR -ASO,3'特異PCR 及引物鐿爭(zhēng)法進(jìn)行確定,而對(duì)于突變優(yōu)點(diǎn)不清 楚或突變優(yōu)點(diǎn)多變的基因則可用PCR -SSCP,DGGE,CDGE,TGGE,PCR -RNSE切割,化簡(jiǎn) 錯(cuò)配切割,異源雙鏈分析長(zhǎng)久法進(jìn)行篩選與遺傳病有關(guān)的點(diǎn)突變,再用PCR 循環(huán)直接測(cè)序確定突變部位和性質(zhì)。

       (二) 利用連鎖分析間接診斷遺傳病   

       在有的遺傳病其基因結(jié)構(gòu)龐大,基因的分子病理改變復(fù)雜或不清楚,或異質(zhì)性較 高,利用PCR 技術(shù)直接檢測(cè)與遺傳病有關(guān)的基因點(diǎn)突變有一定的困難.常常利用一些基 因內(nèi)或其旁側(cè)的一些多態(tài)性標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析,以間接判斷遺傳病,常以PCR 方法進(jìn) 行檢測(cè)的多態(tài)性標(biāo)記有以下兩種:

       1、PCR -RFLP   

       在人類基因組中存在著許多限制性內(nèi)切酶切點(diǎn),這些切點(diǎn)在人群中具有明顯的遺 傳變態(tài)性.因此可用已知DNA序列的基因內(nèi)或其旁側(cè)序列中的酶切位點(diǎn)多態(tài)性以PCR 方 法來(lái)檢測(cè).PCR 擴(kuò)增后用相應(yīng)的內(nèi)切酶進(jìn)行切割相應(yīng)的擴(kuò)增產(chǎn)物,通過(guò)用瓊脂糖蔌聚丙 烯胺凝膠電泳技術(shù)進(jìn)行電泳,分析酶切位點(diǎn)多態(tài)性,在家庭或黃間進(jìn)行連鎖分析.需 要注意的是,在用PCR -RFLP進(jìn)行連鎖分析時(shí)應(yīng)選擇那些雜合頻率多,即具有較高多態(tài) 信息量的酶切位點(diǎn)多態(tài)性.亦可采用多個(gè)多生酶切位點(diǎn)聯(lián)合應(yīng)用。

       2、Amp-FLP   

       在人類基因組中,除RFLP可作為遺傳標(biāo)記外還有一有用的多態(tài)性標(biāo)記,即VNTR(數(shù) 目可變的串聯(lián)重復(fù)序列,和STR(短的串聯(lián)重復(fù)序列)。VNTR的特征是其重復(fù)的核心區(qū)內(nèi)的串聯(lián)重復(fù)單位為6-40nt,重復(fù)次斷在不同個(gè)體有所不同重復(fù)次數(shù)變化亦較大,一般 在幾次到上每次之間。STR的核心重復(fù)單痊為2-5時(shí),其中由雙核苷酸重復(fù)(CA)n或(GT) n(n從10-60次)構(gòu)成的串聯(lián)重復(fù)稱為VNDR.有意義的是,這些串聯(lián)重復(fù)序列在人群中具 有高度的遺傳多態(tài)性,人群中的雜合子比例在50%以上,最高的可達(dá)90%以上,因此它仍可提供更多的多態(tài)信息量.VNTR和STR可用其兩端的序列合成引物,用PCR 進(jìn)行擴(kuò) 增,PAGE+銀染堅(jiān)爾比即Amp-FLP,加之這些片段呈孟德爾或遺傳,因此用之作為連鎖分析的標(biāo)記具有重要價(jià)值。目前Amp-FLP已廣泛應(yīng)用多種遺傳病的連鎖分析如DMD/B MD,DKU等.最近幾年的研究還發(fā)現(xiàn),已可是核苷酸重復(fù)的長(zhǎng)度變異可導(dǎo)致許多人類疾病。目前已證實(shí)的的與人類疾病有關(guān)的致病性重復(fù)之聯(lián)核苷酸有脆性×染色體綜合征 (CGG)>52,肌強(qiáng)直性營(yíng)養(yǎng)不良DM(CTG)>50。 利用串聯(lián)重復(fù)區(qū)所測(cè)序列合成的引物即可對(duì)這些遺傳病時(shí)行基因診斷.。

       三、PCR 技術(shù)在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用

       (一) PCR 技術(shù)在產(chǎn)前診斷中的地位  

       傳統(tǒng)的產(chǎn)前基因診斷主要依賴于以探針為基礎(chǔ)的Southernblotting及RFLP,以此 可診斷缺失型突變及個(gè)別的點(diǎn)突變.但由于其操作的復(fù)雜性及儀器設(shè)備的限制,耗時(shí)長(zhǎng),準(zhǔn)確性不高,尚需同抗素標(biāo)記,因而大大的限制了它所的應(yīng)用.自從80年未PCR 技 術(shù)而始應(yīng)用于產(chǎn)前基因診斷以來(lái),隨著該技術(shù)的發(fā)展,愈來(lái)愈受到人們的重視和歡迎。就目前來(lái)看,它已成為遺傳病產(chǎn)前基因診斷的最常用技術(shù).以此技術(shù)為基礎(chǔ)的各種突變基因檢測(cè)方法已成為遺傳病基因診斷的主要手段。

       (二) PCR 產(chǎn)前基因診斷的途徑   

       1、產(chǎn)前基因診斷胎兒標(biāo)本的來(lái)源   

       由于PCR 技術(shù)本身的特點(diǎn),即可不短時(shí)間內(nèi)將微量的DNA擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍,因此它適應(yīng)于各種來(lái)源的DNA標(biāo)本?! ?/span>

      (1) 羊水穿刺,在如15周后可經(jīng)母親脆壁穿刺獲羊水,其內(nèi)含有大量的胎兒脫細(xì) 胞5-10ml羊水即可獲得足夠量的PCR 分析DNA樣品.   

      (2) 絨毛采樣,在如早期(9-12周)經(jīng)陰道在B超引導(dǎo)采取絨毛樣品,它含有豐富的 DNA.   

      (3) 胎兒血液采集:有簡(jiǎn)條途徑:胎兒臍靜脈穿刺,胎兒鎖采集.   

      (4) 胎兒活檢:可用穿刺取樣,亦可經(jīng)胎兒鏡取樣.可在始17-19周進(jìn)行   

      (5) 母外周血分離胎兒細(xì)胞,目前已用于胎兒性別的預(yù)測(cè).   

      (6) 宮頸刷取細(xì)胞.   

      (7) 著床前取細(xì)胞   

      2、DNA的抽提:不同組織來(lái)源有其不同的提取方法?!?/span>

      3、DNA的擴(kuò)增及檢測(cè)   

       根據(jù)不同的突變及檢測(cè)目的采用不同的檢測(cè)方法,但需要注意的定防止1個(gè)染造 成的假陽(yáng)性結(jié)果。目前利用PCR 技術(shù)能進(jìn)行產(chǎn)前診斷的遺傳病有多種,常常采用多種 方法聯(lián)合應(yīng)用,如連銀分析與突變點(diǎn)直接根態(tài)聯(lián)合應(yīng)用,PCR 與Southern印跡雜交聯(lián) 合應(yīng)用高,以求最下限度的精確。 


標(biāo)簽:  PCR技術(shù) 遺傳病診斷 應(yīng)用   
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